giovedì 20 luglio 2017

Hai avuto un parente affetto di Alzheimer? Sostieni questo progetto Università Firenze

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https://experiment.com/projects/unraveling-the-mystery-of-tpd-43-a-versatile-protein-involved-in-several-neurodegenerative-disorders


Svelare il mistero di TDP-43, una proteina versatile coinvolta in diversi disturbi neurodegenerativi

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Di Mirella Vivoli
Sostenuto da Mirella Vivoli Vega, Fabrizio Chiti, Irene, Dario Diotallevi, Kevin Baldwin, Luca Aresu, Martina Mancini, Michele Longari, Donato Rose Mary, Simone Forcella e altri 75 sostenitori
Informazioni su questo progetto
La proteina TDP-43 è coinvolta nella sclerosi laterale amyotrofica (ALS) e nella demenza frontotemporale (FTLD). Inoltre, la patologia TDP-43 è stata associata a malattie di Alzheimer e Parkinson (Neuman M, Int J Mol Sci, 2009). È sempre più necessario indagare sulle funzioni normali e patologiche di questa proteina, la cui purificazione è difficile da raggiungere, poiché nessuno è ancora riuscito, ma i miei risultati preliminari indicano che è veramente possibile.

Chiedete agli scienziati
CONNESSE LA DISCUSSIONE
Qual è il contesto di questa ricerca?

La questione fondamentale che sto cercando di rispondere è il ruolo del TDP-43 e come e perché questa proteina è coinvolta in molti disturbi neurodegenerativi, che tutti presentano accumulazioni di TDP-43 misfolded. Finora, diversi tentativi di purificazione della proteina a piena lunghezza sono falliti a livello mondiale a causa delle sue proprietà biochimiche e della sua prontezza all'aggregazione. Per ottenere la sua struttura tridimensionale, di vitale importanza per studiare il suo processo di aggregazione, la sua relazione struttura-funzione e il ruolo delle mutazioni patologicamente rilevanti, dovrei ottenere una pura proteina. I miei risultati preliminari suggeriscono che questo è veramente raggiungibile. Per fare questo, avrei bisogno di utilizzare estensivamente lo strumento FPLC, uno strumento che renderà il processo più semplice e veloce.

Qual è il significato di questo progetto?

Le malattie neurodegenerative rappresentano un enorme carico di malattia, in termini di sofferenza umana e costi economici. Queste malattie hanno toccato molte delle nostre vite: i cambiamenti nel comportamento e nella personalità dei nostri cari sono la parte più impegnativa e disturbata di queste malattie. Dato il ruolo centrale di TDP-43 in questi disturbi (Cook C et al, Expert Opin Biol Ther 2008, Buratti E, Adv Genet 2009). E la difficoltà di purificazione di questa proteina, le nostre opportunità per progredire nella comprensione di queste malattie sono attualmente limitate dalla disponibilità di una proteina pura che apre un numero impressionante di studi sulla patobiologia di questa proteina e sulle opportunità di progettare strategie terapeutiche razionali Contro le sue malattie associate.

Quali sono gli obiettivi del progetto?

L'obiettivo finale di questo progetto è quello di purificare il full-length TDP-43 nella sua forma nativa. Sarà prima prodotta nei batteri E. coli, poi sottoposti a diverse strategie di purificazione, che richiedono non solo una persona molto qualificata nella chimica proteica, ma anche un ampio utilizzo dello strumento FPLC. Continuerò quindi ad ottimizzare il rapporto resa / costo della procedura di purificazione con l'aiuto dell'apparecchiatura FPLC e ottenere la struttura tridimensionale di TDP-43 a tutta lunghezza.

Sono molto fiducioso nel successo di questa sfida impegnativa; Per questo motivo concentrerò i nostri studi anche sulle altre forme (mutanti patologici) del TDP-43, che ci aiuteranno a chiarire il suo ruolo vitale nella cellula.

bilancio

Strumento FPLC $ 10.000
L'obiettivo finale di questo progetto è quello di purificare il full-length TDP-43 nella sua forma nativa. Ciò richiederà non solo una persona molto qualificata nella chimica delle proteine, ma anche un ampio uso del FPLC (Fast Protein Liquid Chromatography) strumento, fondamentale per lo svolgimento del progetto di ricerca.

Tutte le altre spese relative alla ricerca saranno coperte dal laboratorio del Prof. Fabrizio Chiti presso l'Università di Firenze, Firenze.




Unraveling the mystery of TDP-43, a versatile protein involved in several Neurodegenerative disorders
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About This Project
The TDP-43 protein is involved in amyotrophic lateral sclerosis (ALS) and in frontotemporal dementia (FTLD). Furthermore, TDP-43 pathology has been associated with Alzheimer's and Parkinson’s diseases (Neuman M, Int J Mol Sci, 2009). It is becoming increasingly necessary to investigate the normal and pathological functions of this protein, whose purification is difficult to achieve as none has succeeded yet, but my preliminary results indicate that this is indeed possible.
Ask the Scientists
What is the context of this research?
The fundamental question I am trying to answer is what is the role of TDP-43, and how and why this protein is involved in several neurodegenerative disorders, which all display accumulations of misfolded TDP-43. So far, several attempts to purify the full-length protein have failed worldwide due to its biochemical properties and to its proneness to aggregation. In order to obtain its three-dimensional structure, which is of vital importance for studying its aggregation process, its structure-function relationship and the role of the pathologically relevant mutations, I should obtain a pure protein. My preliminary results suggest that this is indeed achievable. To do so, I would need to extensively use the instrument FPLC, a tool that will make the process easier and faster.
What is the significance of this project?
Neurodegenerative diseases represent an enormous disease burden, in terms of human suffering and economic cost. These diseases have touched many of our lives: changes in behavior and personality of our loved ones are the most challenging and distressing part of these diseases. Given the central role played by TDP-43 in these disorders (Cook C et al,Expert Opin Biol Ther. 2008; Buratti E, Adv Genet. 2009). and the difficulty in purifying this protein, our opportunities to progress on the understanding of these diseases are currently limited by the availability of a pure protein, which would opens an impressive number of studies on the pathobiology of this protein and opportunities to design rationally therapeutic strategies against its associated diseases.
What are the goals of the project?
The ultimate goal of this project is to purify the full-length TDP-43 to its native form. It will be first produced in the E. coli bacteria, then subjected to different possible strategies of purification, which will require not only a very skilled person in protein chemistry, but also an extensive use of the FPLC instrument. I will then continue to optimize the yield-to-cost ratio of the purification procedure, with the help of the FPLC equipment, and will obtain the tridimensional structure of full-length TDP-43.
I am very confident in the success of this challenging endeavor; for this reason I will focus our studies also on the other forms (pathological mutants) of TDP-43, which will help us to elucidate its vital role in the cell.
Budget
FPLC instrument
$10,000
The ultimate goal of this project is to purify the full-length TDP-43 to its native form. This will require not only a very skilled person in protein chemistry, but also an extensive use of the FPLC (Fast Protein Liquid Chromatography) instrument, which is vital for conducting the research project.
All other research-related expenses will be covered by Prof. Fabrizio Chiti's laboratory, at the University of Florence, Florence, Italy.




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